Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VdrP48281 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VdrP48281 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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VdrP48281 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VdrP48281 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VdrP48281 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VdrP48281 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
VdrP48281 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VdrP48281 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VdrP48281 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VdrP48281 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VdrP48281 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VdrP48281 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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VdrP48281 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VdrP48281 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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VdrP48281 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VdrP48281 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VdrP48281 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VdrP48281 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VdrP48281 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VdrP48281 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VdrP48281 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VdrP48281 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VdrP48281 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VdrP48281 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VdrP48281 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VdrP48281 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VdrP48281 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VdrP48281 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VdrP48281 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VdrP48281 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VdrP48281 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VdrP48281 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VdrP48281 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VdrP48281 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VdrP48281 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VdrP48281 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VdrP48281 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VdrP48281 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VdrP48281 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VdrP48281 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VdrP48281 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VdrP48281 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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VdrP48281 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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