Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax9P47242 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax9P47242 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax9P47242 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax9P47242 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax9P47242 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms