Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Tnfsf9P41274 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Tnfsf9P41274 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Tnfsf9P41274 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Tnfsf9P41274 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Tnfsf9P41274 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Tnfsf9P41274 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Tnfsf9P41274 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Tnfsf9P41274 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Tnfsf9P41274 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Tnfsf9P41274 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Tnfsf9P41274 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Tnfsf9P41274 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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