Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
TtlP38585 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtlP38585 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtlP38585 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
TtlP38585 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
TtlP38585 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtlP38585 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtlP38585 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtlP38585 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtlP38585 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtlP38585 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
TtlP38585 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtlP38585 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtlP38585 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtlP38585 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtlP38585 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtlP38585 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtlP38585 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
TtlP38585 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtlP38585 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtlP38585 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtlP38585 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtlP38585 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
TtlP38585 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtlP38585 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtlP38585 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtlP38585 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtlP38585 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtlP38585 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtlP38585 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtlP38585 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtlP38585 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtlP38585 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtlP38585 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TtlP38585 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtlP38585 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtlP38585 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtlP38585 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtlP38585 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtlP38585 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtlP38585 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtlP38585 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtlP38585 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtlP38585 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtlP38585 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtlP38585 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtlP38585 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtlP38585 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtlP38585 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtlP38585 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtlP38585 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtlP38585 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TtlP38585 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtlP38585 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtlP38585 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtlP38585 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtlP38585 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtlP38585 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtlP38585 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtlP38585 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtlP38585 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TtlP38585 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtlP38585 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtlP38585 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtlP38585 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TtlP38585 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtlP38585 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtlP38585 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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TtlP38585 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtlP38585 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtlP38585 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtlP38585 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtlP38585 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtlP38585 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtlP38585 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtlP38585 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TtlP38585 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtlP38585 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtlP38585 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtlP38585 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtlP38585 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtlP38585 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtlP38585 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtlP38585 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtlP38585 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TtlP38585 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtlP38585 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtlP38585 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtlP38585 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtlP38585 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtlP38585 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtlP38585 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtlP38585 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtlP38585 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtlP38585 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtlP38585 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtlP38585 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtlP38585 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtlP38585 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms