Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprkP35822 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprkP35822 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprkP35822 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprkP35822 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PtprkP35822 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprkP35822 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprkP35822 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprkP35822 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprkP35822 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprkP35822 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprkP35822 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprkP35822 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprkP35822 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprkP35822 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprkP35822 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprkP35822 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprkP35822 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprkP35822 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprkP35822 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprkP35822 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprkP35822 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprkP35822 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprkP35822 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprkP35822 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprkP35822 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprkP35822 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprkP35822 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprkP35822 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprkP35822 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprkP35822 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprkP35822 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprkP35822 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprkP35822 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprkP35822 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprkP35822 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprkP35822 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprkP35822 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprkP35822 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprkP35822 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprkP35822 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprkP35822 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprkP35822 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprkP35822 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprkP35822 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprkP35822 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprkP35822 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprkP35822 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprkP35822 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprkP35822 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprkP35822 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprkP35822 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprkP35822 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprkP35822 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprkP35822 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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