Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms