Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms