Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa5P28312 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa5P28312 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa5P28312 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa5P28312 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa5P28312 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms