Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms