Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

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Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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Tgfb2P27090 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Tgfb2P27090 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Tgfb2P27090 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfb2P27090 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms