Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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