Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms