Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms