Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms