Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms