Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

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Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NefhP19246 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NefhP19246 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NefhP19246 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NefhP19246 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NefhP19246 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NefhP19246 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NefhP19246 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NefhP19246 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NefhP19246 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NefhP19246 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NefhP19246 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NefhP19246 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NefhP19246 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NefhP19246 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NefhP19246 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NefhP19246 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NefhP19246 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NefhP19246 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NefhP19246 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NefhP19246 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NefhP19246 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NefhP19246 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NefhP19246 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NefhP19246 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NefhP19246 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NefhP19246 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NefhP19246 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NefhP19246 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NefhP19246 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NefhP19246 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NefhP19246 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NefhP19246 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NefhP19246 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NefhP19246 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NefhP19246 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NefhP19246 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NefhP19246 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NefhP19246 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NefhP19246 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NefhP19246 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NefhP19246 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NefhP19246 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NefhP19246 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NefhP19246 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NefhP19246 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NefhP19246 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NefhP19246 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NefhP19246 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NefhP19246 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NefhP19246 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NefhP19246 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NefhP19246 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NefhP19246 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NefhP19246 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NefhP19246 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NefhP19246 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NefhP19246 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NefhP19246 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NefhP19246 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NefhP19246 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NefhP19246 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NefhP19246 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NefhP19246 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NefhP19246 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NefhP19246 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NefhP19246 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NefhP19246 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
NefhP19246 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NefhP19246 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NefhP19246 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NefhP19246 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NefhP19246 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NefhP19246 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NefhP19246 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NefhP19246 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NefhP19246 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NefhP19246 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NefhP19246 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NefhP19246 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NefhP19246 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NefhP19246 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NefhP19246 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NefhP19246 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NefhP19246 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NefhP19246 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NefhP19246 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NefhP19246 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NefhP19246 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NefhP19246 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NefhP19246 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NefhP19246 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NefhP19246 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NefhP19246 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NefhP19246 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NefhP19246 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NefhP19246 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NefhP19246 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NefhP19246 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NefhP19246 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms