Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PcnaP17918 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcnaP17918 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PcnaP17918 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PcnaP17918 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PcnaP17918 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PcnaP17918 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PcnaP17918 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PcnaP17918 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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PcnaP17918 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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PcnaP17918 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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PcnaP17918 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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PcnaP17918 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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PcnaP17918 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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PcnaP17918 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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PcnaP17918 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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PcnaP17918 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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PcnaP17918 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcnaP17918 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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PcnaP17918 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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