Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Cxcl2P10889 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl2P10889 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms