Protein–RNA interactions for Protein: P07350

Ifna6, Interferon alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna6P07350 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms