Protein–RNA interactions for Protein: P01901

H2-K1, H-2 class I histocompatibility antigen, K-B alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-K1P01901 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-K1P01901 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-K1P01901 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-K1P01901 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-K1P01901 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-K1P01901 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-K1P01901 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-K1P01901 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-K1P01901 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-K1P01901 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-K1P01901 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-K1P01901 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-K1P01901 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms