Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01648 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01648 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01648 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01648 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01648 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01648 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01648 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01648 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01648 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01648 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01648 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01648 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01648 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
P01648 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01648 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01648 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01648 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01648 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01648 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01648 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01648 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01648 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01648 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01648 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01648 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01648 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01648 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01648 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01648 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01648 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01648 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01648 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01648 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01648 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01648 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01648 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01648 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01648 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
P01648 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
P01648 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
P01648 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
P01648 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01648 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01648 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
P01648 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
P01648 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01648 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01648 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
P01648 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01648 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01648 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01648 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01648 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01648 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01648 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01648 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01648 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01648 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01648 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01648 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01648 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01648 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01648 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01648 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01648 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01648 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01648 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01648 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01648 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01648 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01648 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
P01648 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01648 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01648 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
P01648 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01648 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01648 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
P01648 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01648 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01648 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01648 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01648 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01648 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01648 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01648 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01648 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01648 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01648 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01648 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01648 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01648 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01648 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01648 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01648 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01648 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01648 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01648 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01648 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01648 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms