Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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