Protein–RNA interactions for Protein: O70274

Ptp4a2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a2O70274 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptp4a2O70274 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms