Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copb2O55029 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copb2O55029 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copb2O55029 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copb2O55029 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copb2O55029 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Copb2O55029 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Copb2O55029 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Copb2O55029 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copb2O55029 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms