Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ChkaO54804 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChkaO54804 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChkaO54804 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChkaO54804 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChkaO54804 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChkaO54804 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChkaO54804 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChkaO54804 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ChkaO54804 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChkaO54804 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChkaO54804 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChkaO54804 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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