Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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