Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
FxnO35943 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
FxnO35943 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
FxnO35943 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
FxnO35943 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
FxnO35943 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
FxnO35943 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
FxnO35943 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
FxnO35943 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
FxnO35943 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
FxnO35943 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
FxnO35943 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
FxnO35943 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
FxnO35943 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FxnO35943 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FxnO35943 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FxnO35943 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FxnO35943 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FxnO35943 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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FxnO35943 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FxnO35943 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FxnO35943 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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FxnO35943 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FxnO35943 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FxnO35943 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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FxnO35943 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FxnO35943 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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FxnO35943 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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FxnO35943 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FxnO35943 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
FxnO35943 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FxnO35943 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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FxnO35943 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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FxnO35943 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
FxnO35943 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FxnO35943 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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FxnO35943 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FxnO35943 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FxnO35943 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FxnO35943 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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FxnO35943 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FxnO35943 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FxnO35943 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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FxnO35943 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FxnO35943 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FxnO35943 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FxnO35943 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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FxnO35943 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FxnO35943 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FxnO35943 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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FxnO35943 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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FxnO35943 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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FxnO35943 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FxnO35943 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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FxnO35943 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FxnO35943 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FxnO35943 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FxnO35943 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FxnO35943 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FxnO35943 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FxnO35943 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FxnO35943 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FxnO35943 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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FxnO35943 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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