Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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Prrt1O35449 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Prrt1O35449 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Prrt1O35449 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Prrt1O35449 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Prrt1O35449 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Prrt1O35449 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Prrt1O35449 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Prrt1O35449 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Prrt1O35449 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Prrt1O35449 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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