Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

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Length 495 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smad6O35182 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Smad6O35182 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smad6O35182 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
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Smad6O35182 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Smad6O35182 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Smad6O35182 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Smad6O35182 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Smad6O35182 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smad6O35182 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Smad6O35182 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Smad6O35182 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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Smad6O35182 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smad6O35182 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Smad6O35182 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smad6O35182 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smad6O35182 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smad6O35182 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smad6O35182 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smad6O35182 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smad6O35182 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smad6O35182 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smad6O35182 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smad6O35182 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smad6O35182 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smad6O35182 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smad6O35182 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smad6O35182 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smad6O35182 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Smad6O35182 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Smad6O35182 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smad6O35182 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smad6O35182 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Smad6O35182 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smad6O35182 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smad6O35182 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smad6O35182 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smad6O35182 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms