Protein–RNA interactions for Protein: O35071

Kif1c, Kinesin-like protein KIF1C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif1cO35071 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Kif1cO35071 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms