Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casq1O09165 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casq1O09165 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casq1O09165 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms