Protein–RNA interactions for Protein: O08976

Pbsn, Probasin, mousemouse

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Length 174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PbsnO08976 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PbsnO08976 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PbsnO08976 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PbsnO08976 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PbsnO08976 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PbsnO08976 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PbsnO08976 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PbsnO08976 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PbsnO08976 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PbsnO08976 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PbsnO08976 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PbsnO08976 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PbsnO08976 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PbsnO08976 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PbsnO08976 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PbsnO08976 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PbsnO08976 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PbsnO08976 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PbsnO08976 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PbsnO08976 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PbsnO08976 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PbsnO08976 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PbsnO08976 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PbsnO08976 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PbsnO08976 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PbsnO08976 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PbsnO08976 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PbsnO08976 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PbsnO08976 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PbsnO08976 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PbsnO08976 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PbsnO08976 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PbsnO08976 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PbsnO08976 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PbsnO08976 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PbsnO08976 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PbsnO08976 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PbsnO08976 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PbsnO08976 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PbsnO08976 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PbsnO08976 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms