Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm8888J3QPX5 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm8888J3QPX5 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm8888J3QPX5 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm8888J3QPX5 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm8888J3QPX5 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm8888J3QPX5 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm8888J3QPX5 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm8888J3QPX5 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm8888J3QPX5 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm8888J3QPX5 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm8888J3QPX5 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm8888J3QPX5 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm8888J3QPX5 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm8888J3QPX5 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm8888J3QPX5 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm8888J3QPX5 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm8888J3QPX5 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm8888J3QPX5 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm8888J3QPX5 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm8888J3QPX5 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm8888J3QPX5 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm8888J3QPX5 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm8888J3QPX5 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm8888J3QPX5 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm8888J3QPX5 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm8888J3QPX5 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm8888J3QPX5 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm8888J3QPX5 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms