Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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