Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Gm20918J3QN17 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Gm20918J3QN17 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Gm20918J3QN17 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Gm20918J3QN17 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gm20918J3QN17 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gm20918J3QN17 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gm20918J3QN17 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gm20918J3QN17 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gm20918J3QN17 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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