Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Top6blJ3QMY9 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Top6blJ3QMY9 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Top6blJ3QMY9 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Top6blJ3QMY9 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Top6blJ3QMY9 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Top6blJ3QMY9 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Top6blJ3QMY9 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Top6blJ3QMY9 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Top6blJ3QMY9 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Top6blJ3QMY9 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Top6blJ3QMY9 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Top6blJ3QMY9 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Top6blJ3QMY9 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Top6blJ3QMY9 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Top6blJ3QMY9 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Top6blJ3QMY9 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Top6blJ3QMY9 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Top6blJ3QMY9 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Top6blJ3QMY9 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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