Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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