Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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