Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Igkv1-99F6XWB2 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms