Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms