Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

Predictions only

Length 2,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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BC067074F6RXI4 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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BC067074F6RXI4 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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BC067074F6RXI4 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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BC067074F6RXI4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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BC067074F6RXI4 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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