Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

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Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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