Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms