Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms