Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms