Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms