Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms