Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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