Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms