Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AU015836B2RUM3 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AU015836B2RUM3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms